引物设计为什么在CDS区
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/10/02 08:44:27
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
只能两头设计你不知道基因名字么实在不行拿序列去BLAST上比对下也能知道它前后是啥啦
构建载体需要酶切的,所以需要加接头的!
楼主说的是扩增子,即两引物目标位点之间的序列长度.PCR过程中,扩增就跟修路一样,越长越费工.在能够保证特异性的情况下,当然是越短越有效率,100-200bp就是综合两方面的考虑而建议的最佳扩增子长度
当然可以咯,不过我没明白为什么上游引物GCrich跟分两段扩增有什么关系,1.2K一次扩增是完全没有问题的,如果上游引物出现GCrich的情况,那么可以考虑在更加上游的地方设计引物啊,在这个基因外测的
提RNA的时候有可能混了基因组DNA.这样的话,PCR的时候,假如这个基因根本没表达,结果因为混了DNA进去,PCR就可以P出结果.但是这个条带不是从RNA来的.这就是DNA污染,它会干扰PCR的结果
ATCG.原理就是体外环境模仿人体内环境,完成人体内的DNA复制,大概就这样.
一条引物应该与A链一端的序列一致;令一条引物应该与B链在令一端的序列一致.走向应该都是从5’到3‘向基因内部走.
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.
是不是就是forward和reverse如果是双链DNA做模板的PCR的话就无所谓但是如果是RT-PCR,从RNA生成单链cDNA的话,你的forwardprimer必须跟原来的RNA的序列一个方向,
用primerpremie
因为RNA不稳定,非常容易降解.生活实验中随处可见RNA酶,比如你皮肤上、呼一口气里面,都可能有,可以降解RNA.而且DNA聚合酶它主要是要一个3‘的磷酸基团,所以DNA和RNA都一样.而且RNA掺入
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
首先查道你的基因序列(NCBI搜),第二查引物设计原则,第三下载个引物设计软件设计,简单好用的有primerpremier5.0,这些都能在网上搜到,软件用法也能搜到.
博凌科为-为你是这样,其实片段在一定的范围最好,为什么呢,太长了,片段多,可错配几率就很高,举个例子:两条高特异性的引物如果串成个长的引物,它的错配率不是高了一倍,但为什么说在一定范围呢,因为错配和T
一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
应该是对的.因为G或C能互补配对形成3个氢键,所以结合会更加牢固.