在GENBANK上面查到的线粒体DNA序列,接下来怎么设计PCR引物?
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/21 16:49:10
在GENBANK上面查到的线粒体DNA序列,接下来怎么设计PCR引物?
序列如下,是CYTB的
>gi|207266417:13707-14849 Falco tinnunculus mitochondrion, complete genome
ATGGCACCCAACATTCGAAAATCACACCCCCTAATAAAAATAATCAACAACTCCCTAATCGACCTCCCCA
CCCCATCCAACATCTCCATATGATGAAACTTTGGATCCCTACTAGGAATCTGCCTAGCCACCCAAATCTT
AACCGGCCTACTATTAGCCATACACTACACAGCAGACACAACTCTAGCCTTCTCATCCGTCGCCCACACA
TGTCGAAACGTACAGTACGGATGATTAATCCGCAACCTACACGCCAACGGAGCATCACTATTCTTTATTT
GCATTTACATGCACATCGGACGGGGCATCTACTACGGCTCCTATCTGTACAAAGAAACATGAAACACAGG
CATCATCCTTCTACTCACCCTAATAGCAACAGCCTTCGTCGGCTATGCATTACCCTGAGGACAGATATCA
TTCTGAGGCGCCACAGTAATCACCAACTTATTCTCAGCAATCCCATACATTGGCCAAACCCTAGTTGAAT
GGGCCTGAGGAGGGTTCTCAGTAGACAACCCAACGCTAACCCGATTCTTCGCCCTACACTTTCTCCTACC
ATTCATTATTGCAGGACTCACCCTAATCCACCTCACCTTCCTACACGAATCAGGCTCAAACAACCCCCTA
GGAGTAGCATCAAACTGCGATAAAATCCCATTCCACCCCTACTACTCCCTAAAAGACCTCCTAGGATTCA
TACTCATATACCTCCCCCTAATAGCCCTAGCCCTATTCACCCCAAACCTACTAGGCGACCCAGAAAACTT
TACACCAGCAAACCCCCTAGTCACCCCCCCACACATCAAACCAGAATGGTATGTCCTATTTGCCTACGCC
ATCCTACGCTCAATTCCCAACAAACTAGGATGAGTCCTAGCACTAGCTGCCTCAGTATTAATCTTATTCC
TAAACCCACTACTCCACAAATCTAAACAGCGCACAATAACCTTCCGCCCATTATCTCAATCACTATTCTG
ACTCCTAATCACTAACCTACTTATCCTAACCTGAATTGGAAGCCAACCCGTCGAACAACCATTCATCATT
ATTGGACAACTAGCCTCCCTCTCCTACTTCACCATCCTCCTAATCCTCCTCCCCCTTACCGGAGCCCTAG
AAAACAAAATCCTCAACTACTAA
我想PCR线粒体细胞色素B的这段,但是不会用PRIMER之类的软件,请问是否只要取前后各20个左右的碱基然后AT,GC这样子反过来就是引物了?
还有这段碱基序列到底是什么东西的啊?是线粒体DNA还是mRNA的?
谢谢了
网址如下
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_011307.1?report=fasta&from=13707&to=14849
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6947145#
序列如下,是CYTB的
>gi|207266417:13707-14849 Falco tinnunculus mitochondrion, complete genome
ATGGCACCCAACATTCGAAAATCACACCCCCTAATAAAAATAATCAACAACTCCCTAATCGACCTCCCCA
CCCCATCCAACATCTCCATATGATGAAACTTTGGATCCCTACTAGGAATCTGCCTAGCCACCCAAATCTT
AACCGGCCTACTATTAGCCATACACTACACAGCAGACACAACTCTAGCCTTCTCATCCGTCGCCCACACA
TGTCGAAACGTACAGTACGGATGATTAATCCGCAACCTACACGCCAACGGAGCATCACTATTCTTTATTT
GCATTTACATGCACATCGGACGGGGCATCTACTACGGCTCCTATCTGTACAAAGAAACATGAAACACAGG
CATCATCCTTCTACTCACCCTAATAGCAACAGCCTTCGTCGGCTATGCATTACCCTGAGGACAGATATCA
TTCTGAGGCGCCACAGTAATCACCAACTTATTCTCAGCAATCCCATACATTGGCCAAACCCTAGTTGAAT
GGGCCTGAGGAGGGTTCTCAGTAGACAACCCAACGCTAACCCGATTCTTCGCCCTACACTTTCTCCTACC
ATTCATTATTGCAGGACTCACCCTAATCCACCTCACCTTCCTACACGAATCAGGCTCAAACAACCCCCTA
GGAGTAGCATCAAACTGCGATAAAATCCCATTCCACCCCTACTACTCCCTAAAAGACCTCCTAGGATTCA
TACTCATATACCTCCCCCTAATAGCCCTAGCCCTATTCACCCCAAACCTACTAGGCGACCCAGAAAACTT
TACACCAGCAAACCCCCTAGTCACCCCCCCACACATCAAACCAGAATGGTATGTCCTATTTGCCTACGCC
ATCCTACGCTCAATTCCCAACAAACTAGGATGAGTCCTAGCACTAGCTGCCTCAGTATTAATCTTATTCC
TAAACCCACTACTCCACAAATCTAAACAGCGCACAATAACCTTCCGCCCATTATCTCAATCACTATTCTG
ACTCCTAATCACTAACCTACTTATCCTAACCTGAATTGGAAGCCAACCCGTCGAACAACCATTCATCATT
ATTGGACAACTAGCCTCCCTCTCCTACTTCACCATCCTCCTAATCCTCCTCCCCCTTACCGGAGCCCTAG
AAAACAAAATCCTCAACTACTAA
我想PCR线粒体细胞色素B的这段,但是不会用PRIMER之类的软件,请问是否只要取前后各20个左右的碱基然后AT,GC这样子反过来就是引物了?
还有这段碱基序列到底是什么东西的啊?是线粒体DNA还是mRNA的?
谢谢了
网址如下
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_011307.1?report=fasta&from=13707&to=14849
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/6947145#
当然是dna的啦,引物的设计有很多需要注意的地方哦,不然怎么有primer5 、oligo7之类设计引物软件呢.
在GENBANK上面查到的线粒体DNA序列,接下来怎么设计PCR引物?
不知序列的DNA模板PCR引物的设计
根据GenBank中p53基因的部分序列),设计引物,确定RT-PCR的参数,检测 p53基因在血细胞中的表达情况.
请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?
试举两个进行PCR引物设计的生物信息学程序,并选用其中的任何一个对GenBank登录号为MMU41636 的序列设计一对
给出dna序列怎么设计引物
如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物
如何用 VECTOR NTI设计一段已知DNA序列的PCR引物
我考虑用线粒体DNA序列设计引物,请问我从基因库下载序列需不需要考虑编码和非编码器区,就是普通的PCR,做检测用的.还有
已经知道引物名称,怎么查到引物的序列呢?
如何在pubmed上检索mRNA序列及设计合适的PCR引物?
pcr引物怎么设计