已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的?

来源：学生作业帮编辑：神马作文网作业帮分类：综合作业时间：2024/11/11 18:18:35

已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的?
分析下列序列,并找出与之同源性最高的水稻基因,并尝试利用RGP网站对其功能进行预测分析.
MGASVSRGRAARVPAPEPEPEEALDLSQLPPELLLVVLSHVPPRTLLGRCRQVCRGWRALVDGQALWLLILARDHGATGRALLHLARSCQSPARNARPCPLGRFCARRPIGRNLIRNPCGQEGLRKWMVQHGGDGWVVEENRTTVPGAPSQTCFVTSFSWCCKKQVLDLEEEGLWPELLDSGRIEICVSDWWGARHDSGCMYRLLVQLLDANQTVLDKFSAVPDPIPQWNNNACLHVTHVFSNIKMGVRFVSFEHRGQDTQFWAGHYGARVTNSSVIVRVRLS

使用NCBI在线查询http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastHome
hypothetical protein OsI_12573 [Oryza sativa Indica Group]

已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的? 已知一个小鼠的基因完整序列和CDS序列,请问如何查找这个序列在水稻中的同源基因序列在NCBI上怎么查找某一基因在不同种属中已公布的同源序列检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问用BLAST查找protein 输入的是基因的名字,查出来的是对应的蛋白序列吗? 已知一蛋白质的部分氨基酸序列,怎样克隆编码该蛋白的基因? 某一基因序列由于只能查到人的和鼠的请问怎么通过已知的人和鼠的基因序列 blast出相应猪的基因序列已知蛋白质的氨基酸序列,如何求出编码该蛋白的基因序列已用本地blast找出基因序列,怎么确定它是全长的呢? 如何寻找一段基因的同源序列?如何利用网络查找一段基因的上游调控序列? 用转录组测序的数据库查找两个不同的基因,结果blast后显示的是相同的序列,这是为什么,怎 80.6% 的拟南芥基因与该水稻的基因同源,但该水稻只有49.4%的基因与拟南芥的基因同源.