COI基因的保守序列是什么
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/09/21 11:12:28
COI基因的保守序列是什么
整合子是一种遗传因素,包含一个能捕获外源基因的位点特异重组系统,这些被捕获的外源基因通常是耐药基因(如编码氨基糖苷类、β-内酰胺类、氯霉素、磺胺类等的基因).这些耐药基因被包含在叫做基因盒的单一的移动单元.整合子由两个保守片段即5′端和3′端保守段组成,在5′端保守段包含有编码整合酶的Int基因、Int特异重组位点(attI)和负责基因转录的启动子P1(Pant)和P2?,但P2 仅少见于少数整合子.Int位于整合子5′保守末端,属于酪氨酸整合酶家族,其编码的整合酶识别两个不同的重组整合位点,即位于整合子上的attⅠ位点和位于基因盒的59-be家族成员(attc位点).整合酶负责催化attⅠ位点和一个59-be位点之间、两个59-be位点之间及两个attⅠ位点之间的重组,但两个attⅠ位点之间的重组效率比attⅠ位点和一个59-be位点之间的重组效率低.3′端保守段的结构则因整合子类型的不同而异.基因盒是单一的可移动的DNA分子,通常以环行独立的状态存在.只有当它被整合子捕获并整合到整合子中才能转录.基因盒通常不含启动子,但一旦基因盒插入整合子,这个基因就能在5′端的共同启动子Pant作用下转录.基因盒是由一个ORF(通常是耐药基因)和一个反向不完全重复序列即59-be组成,59-be片段交换位点长度从50 bp 150 bp不等.在反向重复序列的5′端有一个长7 bp反向核心位点RYYYAAC;在3′端有一个核心位点GTTRRRY(R为嘌呤,Y为嘧啶).基因盒插入attⅠ位点导致基因盒下游的此级位点(attc)的形成.一个整合子可以捕获一个或多个基因盒,被捕获的基因盒5′端与attⅠ位点,3′端的59-be片段与attc位点发生特异重组.整合子-基因盒结构如图1.
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