谷子基因组有多大
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/11 16:32:24
谷子基因组有多大
来自深圳华大基因研究院,张家口市农业科学院,丹麦哥本哈根大学的研究人员发表了题为“Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential”的文章,最新完成了一种植物:谷子(foxtail millet,学名Setaria italica)的全基因组测序,谷是目前种植第二广泛的粟类物种,这项研究为提高谷类粮食遗传性状提供了宝贵的资源.
在这项研究中,研究人员利用新一代测序技术,对一种国内北部谷子品系:张谷(Zhang gu)进行了从头测序(de novo assembly),获得了大小约为423Mb(N50达到了1.0Mb),包含38,801个蛋白编码基因的全基因组序列,这些基因预测超过81%已经表达.通过基因组注释和分析发现,谷子基因组中的重复序列约占整个基因组的46%.
在这项研究中,研究人员利用新一代测序技术,对一种国内北部谷子品系:张谷(Zhang gu)进行了从头测序(de novo assembly),获得了大小约为423Mb(N50达到了1.0Mb),包含38,801个蛋白编码基因的全基因组序列,这些基因预测超过81%已经表达.通过基因组注释和分析发现,谷子基因组中的重复序列约占整个基因组的46%.