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在1999年,沙漠鸟面龙的标本被检验出含有角蛋白,是构成鸟类羽毛的主要蛋白质.
　　辽宁省最重要的发现是有羽毛恐龙,这些发现连结了恐龙与鸟类的关系,并导致更多的羽毛与飞行的演化假说.在2007年,马克·诺瑞尔等人发现一个伶盗龙的尺骨有羽茎瘤,被视为是伶盗龙有大型次要飞羽的强烈证据.
　　一个偷蛋龙类的化石与蛋巢,其前臂以类似鸟类的方式内缩.虽然该化石没有羽毛,但该个体在生前极可能具有羽毛,以隔绝蛋与幼体的热量.
　　较小型的兽脚类恐龙可能全都具有羽毛,而刚出生的较大型兽脚类恐龙可能也拥有羽毛,例如暴龙.
　　目前已有众多的恐龙被发现拥有羽毛.
　　古代鸟类,例如孔子鸟,有着很多恐龙的特征,如嘴部的牙齿,手指上的爪,后者的双颞孔型头骨.
　　始祖鸟保有一些鸟类的特征,例如叉骨、羽毛、翅膀及部份相反的首趾.它亦有一些恐龙特征,例如长的距骨升突、齿间板、坐骨突及人字形的长尾巴.奥斯特伦姆亦发现始祖鸟与驰龙科很显著地相似.
　　1、始祖鸟具有典型的恐龙特征
　　始祖鸟是迄今所知最古老的鸟类祖先.19世纪中晚期,科学家在德国巴伐利亚的石灰岩层中首次发现生活在约1.5亿年前的始祖鸟化石.近年来,古生物学家们发掘了更多的始祖鸟化石,已部分证明始祖鸟和食肉的兽脚类恐龙有最近的亲缘关系,支持了鸟类起源于恐龙的理论.出土的化石显示,始祖鸟的脚与现代鸟类大不相同,更接近于兽脚类恐龙.最明显的特征是它的第二个脚趾可以过度伸展,与小盗龙、鸟脚龙等恐龙的脚部几乎一样；此外,始祖鸟的第一个脚趾向内生长,不像鸟类的脚趾那样向外伸展,而有些类似于人类手掌的大拇指；而且它的颚骨向四方放射生长,有明显的兽脚恐龙遗传特征.科学家们说,这些化石不仅表明鸟类起源于兽脚恐龙,也表明始祖鸟不像现代鸟类那样拥有能攀住树枝的脚趾,因而不会在树枝上栖息.与其说始祖鸟是鸟类,还不如说它更像迅猛龙、恐爪龙等兽脚恐龙.
　　2、恐龙蛋化石与鸟蛋非常相似
　　3、恐龙和鸟一样由雄性守巢孵卵
　　4、化石黏性物质证实恐龙和鸟同源
　　5、恐龙在飞行进化时体型会变小
　　学家们认为,在远古鸟类始祖飞向天空之前,他们的体形通常会变小.这是一幅艺术复原图,图中显示的是在蒙古南戈壁出土的大黑天神龙.这种恐龙身长接近70厘米,这表明恐龙在发展出飞行能力以前的体型很小.有关鸟类飞行的起源,学术界一直存在两种对立的假说.一种是地栖起源说,另一种为树栖起源说.前者认为鸟类的飞翔是由它们的祖先恐龙在奔跑、跳跃的过程中逐渐升腾起飞成功的.而后一种假说则认为,鸟类最初的飞行是通过借助树木的高度,先进行滑翔,后逐渐发展产生特有的振翅飞翔的本领的.鸟类飞行的两种起源假说都承认鸟类的祖先具有长长的尾巴,但功能不大相同.地栖起源假说认为它们在奔跑中扇动前肢以增加后肢在地面奔跑的速度,在这一过程中它们身体上的鳞片逐步增大伸长,在奔跑、跳跃的过程中,鳞片最终发展成羽毛.
　　6、恐龙的呼吸系统与现代鸟类似
　　7、恐龙可以象鸟类一样呼吸
　　8、部分恐龙化石有羽毛痕迹
　　根据对1998年在蒙古出土的一只迅猛龙前臂进行研究分析,科学家们认为这种恐龙身上长有羽毛.科学家们后来又在法国西部发现了一块琥珀中,并从中找到完整保存着的7根两亿年前恐龙时期的羽毛,这些羽毛兼具两足兽脚亚目食肉恐龙表皮绒状纤维和现代鸟类羽毛的特征.科学家们认为,这意味着这块琥珀填补了恐龙如何向鸟类进化的重要空缺.
　　9、始祖鸟的足趾与恐龙类似