用的pfu酶,按照说明书的步骤跑的PCR 结果是这样的,请问是什么原因?
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/28 21:25:33
用的pfu酶,按照说明书的步骤跑的PCR 结果是这样的,请问是什么原因?
左边的marker从上到下大小依次为2000、1000、750、500、250、100
左边的marker从上到下大小依次为2000、1000、750、500、250、100
首先一个问题是你的胶做得不好,这种情况其实很简单就可以解决,配方正确的基础上,只要融化的完全,冷却的完全,就可以避免,为什么大家都那么着急,很多人的marker都这个样子,不要急于一时.
再有个你的目的条带如果是250左右那就问题不大,这次结果拖尾严重最主要是胶的问题.
如果不是250左右,但是又出现这个大小的条带,那么还是考虑一下引物的问题吧.
不管核算还是蛋白电泳做一个好的胶才是出好结果的关键啊
再问: 我的目的片段是 700多,这个是引物二聚体吗?我的引物是fp:gcattgcccagtccccaagga rp: tgcgggggagtacgtgggaagg
再答: Range 1: 1 to 21 GenBankGraphicsNext MatchPrevious MatchFirst MatchAlignment statistics for match #1ScoreExpectIdentitiesGapsStrandFrame42.1 bits(21)0.24()21/21(100%)0/21(0%)Plus/PlusFeatures:Query 1 GCATTGCCCAGTCCCCAAGGA 21 | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Sbjct 1 GCATTGCCCAGTCCCCAAGGA 21 Range 2: 763 to 780 GenBankGraphicsNext MatchPrevious MatchFirst MatchAlignment statistics for match #2ScoreExpectIdentitiesGapsStrandFrame36.2 bits(18)15()18/18(100%)0/18(0%)Plus/MinusFeatures:Query 26 GGGGAGTACGTGGGAAGG 43 | | | | | | | | | | | | | | | | | | Sbjct 780 GGGGAGTACGTGGGAAGG 763 你做的是这个么,首先GC含量有点高,那就得相应提高退火温度,所以需要优化一下体系和pcr程序,还有那个250的条带肯定不是二聚体啊哪有那么大的二聚体啊 可不可以适当地提高一点退火温度,延长点延伸时间,就像另一位说的,这个酶的效率可能没有taq高。但是要想从250,变到700多不太可能吧,感觉很有可能是模板的事。 呵呵,我也是局外人,瞎猜而已。
再有个你的目的条带如果是250左右那就问题不大,这次结果拖尾严重最主要是胶的问题.
如果不是250左右,但是又出现这个大小的条带,那么还是考虑一下引物的问题吧.
不管核算还是蛋白电泳做一个好的胶才是出好结果的关键啊
再问: 我的目的片段是 700多,这个是引物二聚体吗?我的引物是fp:gcattgcccagtccccaagga rp: tgcgggggagtacgtgggaagg
再答: Range 1: 1 to 21 GenBankGraphicsNext MatchPrevious MatchFirst MatchAlignment statistics for match #1ScoreExpectIdentitiesGapsStrandFrame42.1 bits(21)0.24()21/21(100%)0/21(0%)Plus/PlusFeatures:Query 1 GCATTGCCCAGTCCCCAAGGA 21 | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Sbjct 1 GCATTGCCCAGTCCCCAAGGA 21 Range 2: 763 to 780 GenBankGraphicsNext MatchPrevious MatchFirst MatchAlignment statistics for match #2ScoreExpectIdentitiesGapsStrandFrame36.2 bits(18)15()18/18(100%)0/18(0%)Plus/MinusFeatures:Query 26 GGGGAGTACGTGGGAAGG 43 | | | | | | | | | | | | | | | | | | Sbjct 780 GGGGAGTACGTGGGAAGG 763 你做的是这个么,首先GC含量有点高,那就得相应提高退火温度,所以需要优化一下体系和pcr程序,还有那个250的条带肯定不是二聚体啊哪有那么大的二聚体啊 可不可以适当地提高一点退火温度,延长点延伸时间,就像另一位说的,这个酶的效率可能没有taq高。但是要想从250,变到700多不太可能吧,感觉很有可能是模板的事。 呵呵,我也是局外人,瞎猜而已。
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