怎么从测序结果中找到引物序列,用Blast可以比对到
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/09/25 16:38:56
是否有引物序列要看你是如何测序的,如果短片段700个碱基以内双向测序且测序结果很好的情况下,应该能看到两端引物序列,如果是单向测序会看到一端引物序列;长片段一般是看不到引物序列的.你说的切除引物序列是
这个百度看一下吧
你去找各大公司的产品手册,上面会有非常详细的随机引物的序列,随机引物非常的多,有上百种
用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了
一定要的.正向引物:5'.CTTCGAAATTC3'反向引物:5'.CCGATCGGGAGA3'回答楼主的补充问题:设计正向引物时,该引物序列应该具有和你待扩增DNA序列接近5‘段处的序列.反向引物设
这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.
可以找一下原始文献,或到ncbi里搜索一下.另外ncbi里有个premer-blast可以试一下.---中国西部生命科学论坛再问:primerblast主要进行序列比对,NCBI没有查询到。
正向测序结果可以找到反向引物的反向互补序列反向测序结果可以找到正向引物的反向互补序列
试试primer软件.
根据mRNA(真核的)设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增
对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公
对上面这个页面进行一下必要的介绍:BLAST的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂
不是再答:对拓扑异构、长度、碱基比例排列、端处有要求。
当然是dna的啦,引物的设计有很多需要注意的地方哦,不然怎么有primer5、oligo7之类设计引物软件呢.
AAAAAAAAA(G/T/C)(G/A/T/C).
找近缘种,越近越好,的那个基因都下下来ncbi或软件都可以比对,找高度保守区具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物,如果有四个是G,两个是A就选G,要是一半
[color=red][/color]4.28送菌液去某公司测序,昨天收到的测序报告连上下油的引物都找不到.后来我又做了菌落PCR(设阳性,阴性对照)有目的条带.请问各位是什么原因啊?测序结果上不会有
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
ncbi上就可以啊,你把你的rna的序列复制进去,点击转换就行了.现在生物信息学已经越来越凶残了.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
运用DNASTAR软件把DNA序列反向互补,然后再用引物去匹配就可以了