蛋白质组学的进展如何?

蛋白质组学的进展如何?
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我国蛋白质组学的主要进展
在国家支持下,中国科学院生物化学研究所、军事医学科学院、复旦大学与北京师范大学等单位迅速启动了蛋白质组研究,建立并组合了二维电泳蛋白质组分离技术、图象分析技术和蛋白质鉴定的质谱技术；先后举办了三次全国性的蛋白质组学术研讨会,并在国际上较早提出了功能蛋白质组学的研究战略.我国蛋白质的色谱/电泳二维分离,二维芯片电泳分离,质谱在线鉴定等方面均取得了重要进展,并得到了国际同行的认同,具有一定优势.
虽然我国蛋白质组学研究启动不久,我国科学家已经在重大疾病如肝癌、维甲酸诱导白血病细胞凋亡启动模型及维甲酸定向诱导胚胎干细胞向神经系统分化的模型等比较蛋白质组研究以及一些重要生理和病理体系的蛋白质组成分研究方面获得了重要成就.在胚胎干细胞诱导向神经干细胞方向分化前后分离出了19个与定向诱导神经分化相关的蛋白；在HL-60细胞凋亡研究中初步筛选到21个凋亡相关蛋白.已进行了肝癌细胞系及正常肝细胞蛋白质组的比较分析研究,发现了两者间不同的蛋白表达群；自行建立了肝癌高/低转移细胞系,进行了原位食管癌/转移食管癌间的比较蛋白质组研究,初步发现了一批与肿瘤转移相关的蛋白质群.通过蛋白质芯片技术对肺癌病人和正常人血清中的蛋白质谱的对比分析,找到了15个差异蛋白并利用Biomarker Pattern 分析软件建立了肺癌诊断分类树模型.初步盲筛结果表明,这15个分子标志可能成为临床诊断肺癌的新指标,有重要应用价值.在大规模人胎肝蛋白表达谱方面初步鉴定出500个高丰度蛋白,150个磷酸化相关蛋白等等.这些研究证明了我国的蛋白质组学技术平台已能支撑一定规模的研究,为我国在该研究领域争得了一席之地,也为未来的发展奠定了良好的基础.
目前,由军事医学科学院牵头的 973计划项目和由上海生命科学院牵头的863计划项目集中了国内十余家优势单位,针对严重影响我国人民健康的重大疾病和重要生命科学问题开展“重大疾病的比较蛋白质组研究”和“重要生理、病理体系的功能蛋白质组研究”.力争在3~5年内建立国际领先水平的蛋白质组学研究通用技术平台,发现一批有重要生命科学价值或与重大疾病相关的蛋白质,为探索基因转录,翻译调控的规律、获得重大疾病预警、诊断标志物和新药研究的靶标作出贡献.
目前,国内已有若干蛋白质组学研究中心或重点实验室相继成立,如复旦大学蛋白质研究中心,军事医学科学院蛋白质组中心,高等院校蛋白质组学研究院,中国科学院蛋白质组学重点实验室和中国医学科学院蛋白质组学研究中心等.其中高校蛋白质组研究院是由国内多所高校、临床单位和国内外有关公司联合建立的研究机构,是我国高校大规模打破学校界限,与国内外多方面力量联手,进军蛋白组组学研究领域所采取的新举措.统一协调有关国内研究的中国人类蛋白质组组织（Chinese HUPO）和蛋白质组专业委员会等也在筹备中.
蛋白质组学发展趋势
在基础研究方面,近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域,如细胞生物学、神经生物学等.在研究对象上,覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围,涉及到各种重要的生物学现象,如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等.在未来的发展中,蛋白质组学的研究领域将更加广泛.
在应用研究方面,蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一.在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景,目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究.
在技术发展方面,蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和局限的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法.除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征.另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益显著和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,所呈现出的系统生物学（System Biology）研究模式,将成为未来生命科学最令人激动的新前沿.