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解题思路： 理解微生物生理，以及有关微生物的实验操作的原理和步骤
解题过程：
从微生物中提取果胶酶，是利用某些类型的微生物会寄生在植物细胞间隙，由于植物细胞外层是细胞壁，主要成分为纤维素和果胶，所以微生物是将细胞内产生的果胶酶分泌到细胞外，用以分解植物细胞壁的。所以提取果胶酶是从培养液的上清液中。
其次是进行对比，测定的是一定时间后粗提果胶酶与适量果胶融合液体的吸光值，此时部分果胶被水解，但是酶的数量不变。对比时就需要知道原有的酶量和果胶混合后液体的吸光值，所以要选择失活的果胶酶和果胶溶液混合，并且遵守等量原则。
最终答案：上清液 等量的失活果胶酶溶液