第一个文件是基因名称,第二个文件包括基因名和基因序列,需要根据第一个文件的基因名提取基因序列
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/12 20:39:45
第一个文件是基因名称,第二个文件包括基因名和基因序列,需要根据第一个文件的基因名提取基因序列
我有两个文件.第一个是基因名称文件,第二个包括基因名称和基因序列,是以FAS格式保存的,而且第二个文件不仅包括了第一个所有的基因,同时还有其他基因.我想用从第二个文件中提取第一个文件中的所有基因名称的序列,并用以下格式保存
>基因名称
序列
>基因名称2
序列
我有两个文件.第一个是基因名称文件,第二个包括基因名称和基因序列,是以FAS格式保存的,而且第二个文件不仅包括了第一个所有的基因,同时还有其他基因.我想用从第二个文件中提取第一个文件中的所有基因名称的序列,并用以下格式保存
>基因名称
序列
>基因名称2
序列
DNAMAN比对可以确定两者同源性,也就是说这样可以知道第一个文件中的序列在第二个文件的位置和一些相关信息.
如果有担心遗漏的话DNASTAR等软件搜索CDS然后在NCBI上比对一下就可以大体上知道是那些基因,当然如果该基因未被研究并标记的话就查不到了.
如果是基因组学或者转录组学方法的数据结果的话也有专门的软件支持,只是不太明白你的数据是如何得出的,文库?转录组?重测序?你要做的是基因注释还是就分类呢?
如果有担心遗漏的话DNASTAR等软件搜索CDS然后在NCBI上比对一下就可以大体上知道是那些基因,当然如果该基因未被研究并标记的话就查不到了.
如果是基因组学或者转录组学方法的数据结果的话也有专门的软件支持,只是不太明白你的数据是如何得出的,文库?转录组?重测序?你要做的是基因注释还是就分类呢?
给定一段基因序列:ATCGACCGTAACC 在第一个基因是A的条件下,第二个基因是T的概率 是多少?
基因序列
如何把NCBI上搜索到的基因序列以文件的形式保存到本地
______________基因的编码序列
求高人帮忙做下C-myc癌基因序列的分析,注释,编辑序列提交文件,蛋白质水平分析.求连接.重谢.
ncbi上的基因序列是编码链还是模板链呢?如果通过基因名选择,出来是一个反向的序列,对引物设计有无影响?
如何查找一个基因的特异性序列和保守型序列?
蛋白质的基因序列和氨基酸序列有什么区别?
基因中,什么是调控序列?包括什么?
已知一个小鼠的基因完整序列和CDS序列,请问如何查找这个序列在水稻中的同源基因序列
我目前拥有个基因的完整序列,想将核酸序列和蛋白质序列整理在一起,该用什么软件?
DNA基因序列重组疗法好吗?在网上看到有个疗法叫DNA基因序列重组疗法,有治疗过的朋友没有,效果到底怎么样?