应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/09/30 11:36:16
应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?
我是MEGA软件初级使用者,现在想建一个目的基因的系统进化树,想请教大家在建树时要将同源基因的核酸或蛋白序列作为比对序列,且转化为FASTA格式,那么在转化后是否需要将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为FASTA格式,并将其保存一个文件?如果不将目的基因序列一起保存在一个文档的话,建好的进化树会不会只是同源基因间的,而在进化树中找不到目的基因?
我是MEGA软件初级使用者,现在想建一个目的基因的系统进化树,想请教大家在建树时要将同源基因的核酸或蛋白序列作为比对序列,且转化为FASTA格式,那么在转化后是否需要将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为FASTA格式,并将其保存一个文件?如果不将目的基因序列一起保存在一个文档的话,建好的进化树会不会只是同源基因间的,而在进化树中找不到目的基因?
不是转化成fas格式,应该是转化成meg格式的,然后在进行发育树的构建.
再问: 嗯,请问是否需要也将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为meg格式,并将其保存一个文件
再答: 你先需要将你的目的序列和你需要进行比对的序列一起比对,得到一个比对的结果,将比对的结果保存为fas,在convert称meg格式,我之前做系统发育树的时候是先用bioedit进行比对的,mega没有试过。你可以看看我上传的百度里的关于mega说明书
再问: 嗯,请问是否需要也将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为meg格式,并将其保存一个文件
再答: 你先需要将你的目的序列和你需要进行比对的序列一起比对,得到一个比对的结果,将比对的结果保存为fas,在convert称meg格式,我之前做系统发育树的时候是先用bioedit进行比对的,mega没有试过。你可以看看我上传的百度里的关于mega说明书
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