需要学过生物信息学,我这里有期末考试题,熟悉PDB数据库、蛋白质序列、mRNA
来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/17 15:55:02
需要学过生物信息学,我这里有期末考试题,熟悉PDB数据库、蛋白质序列、mRNA
和基因组序列,有四个题,需要熟悉许多软件,这对我非常重要,关乎前途!完成后必有重谢(除了分数之外)!
和基因组序列,有四个题,需要熟悉许多软件,这对我非常重要,关乎前途!完成后必有重谢(除了分数之外)!
题呢
再问: 1、从PDB数据库中找一个3D结构已知的蛋白,查询取得其蛋白质序列、mRNA序列(仅包含ORF/CDS)和基因组序列; 2、用Homologene或BlastP从蛋白质数据库中找出15种以上与其高度同源(Coverage>80%, 相似性>80%)的蛋白质序列,将序列下载并保存为一个FASTA格式的文件; 3、找到每个蛋白相应的mRNA序列,截取从起始密码子到终止密码子的开放阅读框/编码序列(ORF/CDS),将序列下载并保存为一个FASTA格式的文件;
再问: 1、从PDB数据库中找一个3D结构已知的蛋白,查询取得其蛋白质序列、mRNA序列(仅包含ORF/CDS)和基因组序列; 2、用Homologene或BlastP从蛋白质数据库中找出15种以上与其高度同源(Coverage>80%, 相似性>80%)的蛋白质序列,将序列下载并保存为一个FASTA格式的文件; 3、找到每个蛋白相应的mRNA序列,截取从起始密码子到终止密码子的开放阅读框/编码序列(ORF/CDS),将序列下载并保存为一个FASTA格式的文件;
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