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用NCBI搜目的基因序列时会出来好多,怎么分辨那个是自己想要的?

来源:学生作业帮 编辑:神马作文网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/11/13 15:20:37
用NCBI搜目的基因序列时会出来好多,怎么分辨那个是自己想要的?
用NCBI搜目的基因序列时会出来好多,怎么分辨那个是自己想要的?
不知道你搜序列是用来做什么的?如果是用于表达分析,建议选择有full length cDNA的;如果是用已知基因序列片段搜索,一般选择匹配度最高的,同时参考“来源生物”
再问: 怎么选择匹配最高的呢?有的显示是complete sequence 片段很大,有的是complete cds 片段小一些,我该选择哪一个到phytozome里面找我的基因呢?谢谢你!
再答: 如果是序列比对的结果,匹配最高的排在最上面,红色越深。 在设置搜索参数时,最好选择来源生物或是相近的基因组/蛋白组数据库,可以排除很多干扰