我扩增的这段片段能否提交到NCBI GENEBANK?

来源：学生作业帮编辑：神马作文网作业帮分类：英语作业时间：2024/11/17 01:02:45

我扩增的这段片段能否提交到NCBI GENEBANK?
我根据已报道的cDNA全长序列,用特异引物扩增了一段保守的片段,用作探针.这段片段1kb,原来的全长是3.5kb.我得到的这段片段能否提交到genebank里?
我为了检测一个已知的HOX酶的基因在拟南芥中的表达模式,这个基因的cDNA序列和全长序列都已经报道过了.我只是扩了一段它的中间片段作探针进行Nortern杂交.我是根据genebank中已知的拟南芥HOX基因的cDNA的序列,设计了一对特异引物,用反转录得到的cDNA为模板,扩增得到的一段1003bp的产物,blast显示它只有一个碱基突变.我得到的这段序列能不能提交到genebank里呢?我听说曾经有人提交过类似情况的已知序列,

是不是你得到了1kb的片段,而报道的是3.5kb?
你这个片段扩增的模版是自己构建的文库么?有没有可能你文库的构建导致了cDNA的序列得到不完整?建议用5' 3'RACE将完整的序列得到后,再与genebank进行比对.如果1kb是就是完整的话,建议blast寻找同源序列,并且搞清楚这个基因的来龙去脉,然后才可以提交到genebank.
blue bulletSubmissions to GenBank
Many journals require submission of sequence information to a database prior to publication so that an accession number may appear in the paper.The WWW-based submission tool,called BankIt,for convenient and quick submission of sequence data.Sequin,NCBI's stand-alone submission software for MAC,PC,and UNIX platforms,is available by FTP.When using Sequin,the output files for direct submission should be sent to GenBank by electronic mail.
There are specialized,streamlined procedures for batch submissions of sequences,such as EST,STS,and GSS sequences.
你检测到的突变有意义,在野生型中有普遍性,说明了问题,能够发paper了,才可以去递交.否则就是一个突变点没有任何意义,况且看你的描述,你都不确定是不是PCR引起的突变,或者模版引起的突变.单纯的点突变即时存在,没有任何意义,也是不能递交的

如何在GeneBank登录序列?我现在有几个自己扩增得到的基因序列,想把它们登录到GeneBank,该从哪申请登录我克隆了一个基因,序列与参考序列完全一致,我克隆的这个序列还有没有必要提交到NCBI上? 如何提交基因序列到NCBI GENBANK上? 如何在NCBI上寻找要扩增的序列? pcr扩增出来的东西与模版dna完全一致吗?还是说只扩增出模版中的某一段序列（我们需要的基因片段）? ncbi提交序列问题提交序列时,在Coding Region Interval部分,问到If your sequence 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗? 将基因登陆到ncbi我克隆出白鲢鱼的一段基因,想登录到ncbi,请问,谁知道具体的登录办法,具体一点可以么,谢谢 PCR仪一般每分钟扩增多长的片段 PCR为什么能扩增特意的基因片段呢 PCR引物设计问题我是要扩增一个片段,加上双酶切位点,片段就那么大,我就需要那么大加酶切位点?这引物怎么设计?是不是只要设计pcr体系质粒扩增扩增片段1.8kb两引物都是87碱基pfu酶怎样设计预变性变性退火延伸的时间和温度我的引物g