NCBI的基因组序列是反向的
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/10/06 12:31:52
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
简单说一下如何查找基因,首先你要知道这个酶是人源的还是鼠源或是你需要检索的其他物种,登陆NCBI,在检索框中直接搜索基因名字,会出现关于这个基因的所有信息,你要是只想要基因序列就选择里面的Nucleo
搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长;有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区;cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
Amphiprionfrenatus:白条海葵鱼(一种观赏鱼)voucherFMNHBus03-5T-128:编号FMNHBus03-5T-128bonemorphogeneticprotein4ge
一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo,查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GENE改成protein,同样查找
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov,上面搜索条,下拉菜单选gene,后面输入你要找的基因名,加种属名,如人的加homo,点search,选择你要的基因进入,里面有详细介绍,下拉
好像用proteinworshop可以看
mRNA,completecds意即根据rna翻译的cDNA序列.没有内含子的
这个应该去GenBank不应该到NCBI吧~再问:貌似您不总用NCBI啊.....(还有一件不太重要的事......NCBI里就包括GenBank,不重要了不过)GenBank也可以凑合了......
因为NCBI是按模板链给的,毕竟基因间的比对用得较多,改成U太麻烦,你自己知道mRNA中T应该是U就好了
是编码链.用错链对引物设计有影响,因为核苷酸结构不对称,分三端和五端.所以5'-ATCGXXXXXXXXXXXXXX和3‘-ATCGXXXXXXXXXXXXXX是两个不同的引物分子.引物设计软件都使用
ncbi序列既有cDNA序列也有mRNA序列,一般会有注释的.如果已经说明是mRNA就不可能是cDNA.mRNA是以正义链的形式给出的,所以是T而不是U.这可能是因为序列提交者一般只对DNA测序,而很
第二条结果.查找方式:选择GenomeProject,查找arabidopsisthaliana
按编码功能分:蛋白质编码序列;rRNA基因、tRNA基因等RNA编码基因;基因间隔区序列、重复序列等非编码序列;其它功能序列,如复制起点、端粒区、转座子元件等.
编码链.因为你从NCBI上可以用它的ORF搜索工具搜索DNA上的ORF的.软件识别的是DNA序列上的ATG和TAA\TAG\TGA的.因此它的DNA序列肯定是编码链的.