神马作文网怎么知道细菌16s rdna序列的可变区?
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/06 10:55:20
还需要和菌种的形态学观察、生理生化结果（参照《伯杰氏细菌手册》第8版相关内容进行）综合参考才能得出结论.再问：好比说我现在16srDNA鉴定到了属，接着就从这个属开始做一些生理生化实验，最后得出结果吗
如图,在序列窗口中找到图中红圈的那一栏里找到Duration,如果没有Duration,就在那里右击——Columns -- Duration就有了,然后单击那黄色的时间信息,弹出
推荐方法：先输入1.光标放在1的单元格,编辑——填充——序列——序列产生在——行（勾选）——步长——1——终止值——60000——确定.
你去找各大公司的产品手册,上面会有非常详细的随机引物的序列,随机引物非常的多,有上百种
用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了
www.pubmed.gov搜索框的下拉菜单选Nucleotide,框中输入基因名,点击Search,或按Enter键.
先找到DNA序列的ORF,从ATG开始,三个碱基一组,用密码子表对比进行翻译就好了,到终止密码子结束.很多生物软件都有直接翻译的功能的.
北京三博远志16srdna测序/鉴定说明：1、样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA.2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul.3、鉴定结果一
原核：5'有对应RNASD序列的片断,包含多个ORF真核：ORF中没有内含子,3'有对应Poly(A)的TTTTTTT,另外：不管是原核还是真核,其两端一定有5'UTR及3'UTR,这也是我们要作RA
可以找一下原始文献,或到ncbi里搜索一下.另外ncbi里有个premer-blast可以试一下.---中国西部生命科学论坛再问：primerblast主要进行序列比对，NCBI没有查询到。
--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,
这有啥好系统讲的,单端测序的数据比对一下就完了,还能咋样?
就是通过测定16srRNA的序列来对病原菌进行定种.16srRNA鉴定是很经典的微生物定种方式啊.再问：有没有这方面的资料推荐，非常感谢再答：这个太多了，谷歌学术里一搜一大把。
提取细菌总DNA再用细菌16srDNA通用引物PCR出16s序列,电泳找到所需条带,回收然后送到测序公司测序
这位大哥收集了,去看看吧,很不错的资料!
V3区是在通用引物所扩增的序列的一部分.V3区引物的变异性相对于通用引物27F/1492R而言更高.
这可是个生物信息学大难题,搜搜“同源模建”,一大堆参考资料可以找到.不列举了
这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,
双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接.另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列.做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的Se
ncbi上就可以啊,你把你的rna的序列复制进去,点击转换就行了.现在生物信息学已经越来越凶残了.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/