怎么从NCBI中下载比对上的DNA序列
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/13 21:05:40
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
用contig1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Maxident均为96%.
怎么会没有.自己看清楚点.有个“sendto”的下拉框.选“sendtofile”就是下载咯
你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
1)输入fasta格式序列2)选择核算比对
动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分
找到序列后,ncbi上面靠左一些,屏幕的1/4处,有链接可以直接点.
1,如果你知道基因名称的话,进入NCBI主页,在选项后面选择GENE然后输入你要查找的基因名称.2,如果你知道基因序列的编号,选择NECLEOTID然后输入你的序列ID即可3如果你知道有关基因的部分信
1打开NCBI主页2左边search里面选择GENE右边的对话框里输入你想要的基因名称3在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homosapiens是人Feliscatus是猫.选择你想要的种属
原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时
打开NCBI网站,在search中选择Nucleotide核酸序列,后面输入你想找序列的拉丁文,搜索,点击序列,选着fasta格式,在上方中间位置send选择file,createfile就下载下来了
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问:不行没查到可能是我也不会操作吧再答:1、NCBI选择nucleotide,输入基因名,获得该基因某物种的序列。如果已经
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
下什么,免费的文章直接下就行,收费的要交美元很贵.genebank免费,可下载序列.最好找个用的熟的人给你演示一遍.