神马作文网引物设计中有transcript variant
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/19 22:01:50
这里有primerblast,使用相当方便,就是网速有点慢
引物的设计一般要考虑以下几个问题：1.长度,至少要16bp,通常为18-30bp2.解链温度（Tm值）3.避免引物内部或引物之间存在互补序列（3个碱基）,从而减少引物二聚体的形成以及引物内部二级结构的
这是针对逆转录pcr而言,所谓的跨外显子就是一个引物（比如上游引物）、出现在两个外显子交界,那么做RT-PCR时,dna由于2个外显子被内含子隔开,引物就不会起作用了
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问：等于白说
构建载体需要酶切的,所以需要加接头的!
若是根据已知序列扩增未知物种的相应序列,可以根据先根据已知序列进行Blast搜索,发现其他同源序列,保存后进行比对,找出其中较保守区域,并根据Primer或Oligo等软件对某条序列进行分析,搜索其中
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
用primerpremie
一、可以使用oligo6或者primer5等软件设计.用这些软件选择引物,主要就是看引物的稳定性,形成二聚体的可能性,退火温度等等参数.二、如果你的序列同源性不高,GC含量也还可以的话,可以使用一些经
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
在两个外显子上设计上下游引物就可以再问：跨外显子是吗？再答：是的，在相邻的两个外显子上就好。
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
用DNASTAR还不错!或者直接用FRIMER再问：探针设计呢再答：基因探针设计其实和引物设计没什么很大的差别，就是你设计的引物在合成的时候需要进行碱基修饰
首先查道你的基因序列（NCBI搜）,第二查引物设计原则,第三下载个引物设计软件设计,简单好用的有primerpremier5.0,这些都能在网上搜到,软件用法也能搜到.
我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因.是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段再问：我需要检测的分子，在nucleotide里找不
一般使用primer5就挺好,不知道你是扩基因还是启动子,基因是否是已知.PCR引物设计原理:PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关
16个退火温度太低了吧18-20不错再问：我需要使退火温度低点。16个会导致非特异性扩增吗再答：会不会有非特异性扩增得去blast一下才知道不过肯定是越短概率越大就是
可以在引物上添加不配对的碱基,但是在引物的3‘端,至少有三个碱基是严格配对的.但是这样的操作主要是为了添加酶切位点或者flag等.Tm值是根据两条链的退火情况来计算,不配对的碱基不算在内,所以你添加不
不用太纠结,有点儿具体也是可以的,一般都能P出来.再问：很多mRNA选择设计不同长度的引物，没有一对是无found显示的，真的很让人纠结；请问文献上的引物有的也是这样吗，不完美，但能扩出来，不会影响q
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握