如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/09/28 17:23:34
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工
粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做
首先选择Gene的标签,输入基因名,然后点击搜索,然后出来一大堆基因,选择你的那个物种的基因,点击,进去看一下,选择Mapviewer然后找到序列,选择基因的外显子上游2000bp,下载...
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?
首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是
看性质可以翻译一下在看嘛
NCBI功能详介和使用方法
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin.用那种办法,根据不同的需要.BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.g
可以试试blast程序,在主页的右上方
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问:不行没查到可能是我也不会操作吧再答:1、NCBI选择nucleotide,输入基因名,获得该基因某物种的序列。如果已经
知道了名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能.ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列,从AUG开始,直到终止子
你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是
你进入Protein的Entrez,用蛋白质AccessionNumber查找到蛋白质之后会给你连接的,每个蛋白质不一样如果没有NC号,就用BLAST搜索,使用tblastn工具,最前面的一个就是相应
在前面的框里选gene,后面输入金黄色葡萄球菌的英文名和glucan,然后go,就可以了